Transparency Internasional Indonesia melakukan survei terhadap Indeks Persepsi Korupsi (IPK) di 50 kota indonesia. Hasilnya kota Yogyakarta merupakan kota yang terbersih dari korupsi dan Kota Kupang merupakan kota yang menyandang gelar kota terkorup. Hasil ini juga diidentikkan dengan urutan pemda terkorup di indonesia.

baca selanjutnya untuk melihat peringkat selengkapnya. Inilah urutan kota dari yang terbersih hingga yang terkorup :
1. Yogyakarta dengan skor 6,43
2. Palangkaraya 6,10
3. Banda Aceh 5,87
4. Jambi 5,57
5. Mataram 5,41
6. Surakarta 5,35
7. Tasikmalaya 5,12
8. Banjarmasin 5,11
9. Samarinda 5,03
10. Pangkal Pinang 5,03
11. Ternate 5,01
12. Jayapura 5,01
13. Malang 5,0
14. Jember 4,96
15. Kediri 4,9
16. Balikpapan 4,83
17. Gorontalo 4,83
18. Makassar 4,7
19. Padang 4,64
20. Sampit 4,6
21. Semarang 4,58
22. Bandar Lampung 4,58
23. Serang 4,57
24. Palu 4,5
25. Bengkulu 4,46
26. Batam 4,44
27. Sorong 4,39
28. Tenggarong 4,38
29. Tanjung Pinang 4,35
30. Ambon 4,32
31. Surabaya 4,26
32. Denpasar 4,25
33. Sibolga 4,25
34. Lhokseumawe 4,14
35. Mamuju 4,08
36. Jakarta 4,06
37. Manado 3,98
38. Pematang Siantar 3,96
39. Palembang 3,87
40. Medan 3,84
41. Cirebon 3,82
42. Pontianak 3,81
43. Bandung 3,67
44. Padang sidempuan 3,66
45. Pekanbaru 3,55
46. Purwokerto 3,54
47. Kendari 3,43
48. Manokwari 3,39
49. Tegal 3,32
50. Kupang 2,97

Yogyakarta Kota Terbersih, Kupang Terkorup
Dari 50 kota yang disurvei dalam IPK Indonesia 2008, Yogyakarta mendapatkan skor tertinggi yaitu 6,43. Nilai tersebut dapat dibaca bahwa pelaku bisnis di Yogyakarta menilai pemerintah daerah cukup bersih, dan cukup serius dalam usahanya memberantas korupsi. Interpretasi ini dapat menggambarkan hal yang sama di kota-kota yang berada di urutan teratas kota dengan skor tertinggi, seperti Palangkaraya (6,1), Banda Aceh (5,87), Jambi (5,57), dan Mataram (5,41).